微生物与免疫学是高职高专生物制药专业的一门重要的专业基础课。目前生物制药专业沿用的微生物与免疫学理论教学体系，注重学科的系统性与完整性，而应用性与实际操作性较差，与生物制药专业具体工作过程联系不紧密，不能满足制药企业对人才的需求。为了解决原有教学模式及教材与目前制药企业对人才需求的矛盾，以“深化教学改革，加强综合素质教育，提高教学质量，建立新型教学模式”为具体目标，在建设微生物与免疫学课程中，按照高职高专人才培养的基本特征，以培养高等技术应用性专门人才为根本任务，以适应社会需要为目标，以提高学生实践动手能力为目的，改革传统的教学模式，对原有课程进行结构性改革，建立可行的课程标准和教学大纲，编写项目式教学法教材并制定配套的考核评价标准，完善立体化的教学体系，使之更有利于学生的学习。
1 改革教学模式
改革以往理论加实践的教学体系，在内容方面主要以项目教学为主，每一项目下分为若干模块，在每一模块下又分为若干个任务。以实训的方式支撑每一个任务。把整门课内容以任务的形式逐一让学生们去解决。理论与实训融合在一起，利用情境教学方法使学生边学习边动手，以实训带动理论学习。
学生在完成一个任务的过程中，通过对技能实验的操作引发学生探索相关理论知识的兴趣，在这时讲授相关的理论知识，学生乐于接受，使原本枯燥的理论变成学生主动要求学习的内容。真正实现让学生参与到课堂中来，以学生为主体，充分调动学生的学习积极性。新的教学模式修正了以往生物制药专业微生物与免疫高职高专与本科教学过于类似的问题，适应当今制药企业对人才的动手能力的需要；充分体现高职高专的特点，使实践技能的培养贯穿到每个项目的各个任务中，解决以往的教学理论与实训分开的现象。
2 改革教材结构
在教材整体结构方面，改革以往理论与实训分开的教材模式，采用项目式教学法，将整本教材分为若干个大的项目，每一项目下分为若干模块，在每一模块下又分为若干个任务。
每一个任务都与企业实际生产相联系。实训项目是以解决每一个任务为目的设立的，通过对实训的动手操作及相关理论知识的学习最终解决每一个任务。即每一个任务中都有动手环节和支撑的理论知识。由于要解决的任务都是生产中的实际问题，这就使学生对理论和实训都产生了浓厚的兴趣。通过教材改革不但提高了学生的学习积极性，也提高了教材的实用性，使之更靠近岗位工作过程。
3 合理取舍教材内容
在教材内容取舍方面，以往生物制药的微生物与免疫学教材对于微生物代谢这部分知识讲述比重过大，机理阐述过细，这方面知识对于学生今后工作的指导意义不大，应该对微生物代谢部分进行简略的介绍，对于代谢的机理不必过于详细的阐述。另外以往教材普遍缺少常见病原细菌和病毒的知识。由于有很多生物制药企业生产兽药，他们要求学生掌握常见病原体的检测方法。所以常见病原细菌和病毒的知识对于制药专业的学生是必要的。在教材上应该添加此部分内容。
通过教材改革可以解决以上教材内容不适应现在制药企业对人才的知识结构的需要问题。此外，还要更新教材上陈旧的知识内容，将最新科研成果编进教材。
4 合理使用多媒体等先进教学手段
多媒体作为现代化的教学手段近年来在微生物与免疫教学中已广泛应用。多媒体可以以文字、声音、图像及形象动画的方式将语言难以描述和黑板无法展示的内容以视频和声音的方式展现出来，使原本抽象的问题变得具体，微观的物体变得宏观化。使学生对难理解的知识点通过多媒体能一目了然，降低了学习难度。例如，在讲解抗原、抗体时，播放抗原抗体结合过程的动画，使学生能很容易理解抗原抗体特异性结合的原理。需要提出的是，如果整堂课都用多媒体教学，把所有理论的文字都打在课件上，学生从头到尾都盯着课件，就会使学生失去学习的兴趣，不一定能产生好的教学效果。多媒体作为一种辅助的教学手段应合理的对其进行使用，应把多媒体和传统教学手段相结合，演示与讲解相结合。多媒体所起到的作用应是弥补传统教学手段的不足，而不是代替传统教学成为单一的教学手段。
5 改革考试模式
为满足教学改革的需要，对考试内容、考试方式和评分标准等进行了一系列改革。考试内容加强技能运用，突出学生职业能力培养，将单一的闭卷笔试考试方式改为笔试 + 口试 +技能考试 + 随堂考试的综合评定方法。避免了一考定乾坤的弊端。以往期末闭卷笔试部分学生凭借的不是平时的认真学习，而是临考前突击复习，结果考试结束后知识很快忘记了，这种考试的效果显然与考试的初衷不符。将考试增加技能考核部分的权重，有利于全方面考核学生学习成效。其中口试的程序为抽签-准备-口试-（纠正）-记分的形式。既考核了学生的真实成绩，又锻炼了学生的心理承受能力、应变能力。
课程结束后，以问卷调查或座谈会的形式，反馈教改信息，总结经验，更好地提高教学质量。
