2.职能指标。根据各行政事业单位不同的职能和管理特点设置职能指标，主要用于考察行政事业单位的管理效率和工作业绩。根据各行政事业单位职能的不同，可以划分为经济调节、社会管理、公共服务三个二级指标。
经济调节：GDP 增长率，财政收入，就业率，通货膨胀率等。
社会管理：刑事案件的发生率，交通事故死亡率，突发事件应急处理效果等等。
公共服务：基础设施建设，信息公开度，群众满意率等。
3、内部管理指标。各单位内部管理水平的高低决定着其履行职能的好坏，也决定着政府能否和谐、可持续的发展。内部管理指标应该包括：组织结构和人员配备、内部控制、业务流程三个二级指标。
组织结构和人员配备：组织结构设置的合理性，人员编制及超缺编情况，人员的业务水平以及职业道德。
内部控制：单位的内部控制制度的建立与执行情况。
业务流程：业务流程制度的合法合理性以及执行效果。
（二）公共工程项目评价指标
公共工程项目由于投入大、周期长而受到公众的广泛注意，政府投资数额较大的工程一般要实行工程造价审计，对公共工程的绩效审计应集中在项目资金合规性、项目执行的严谨性以及项目产生的效益型三个方面（如表 2 所示）。
项目资金合规性：评价资金的实际来源渠道是否合规；资金的数额、到位时间是否满足项目进度的要求；资金使用是否合理，建设资金是否专款专用；资金支出结构是否合理、合规；资金的支出标准是否符合有关规定，有无违反规定擅自提高或降低开支标准的问题，项目建设过程中是否存在超规模、超标准、擅自增加建设内容等违规情况。
项目执行的严谨性：评价项目的论证是否充分，可行性研究是否确实可行；项目立项、设计、施工、监理等环节是否规范、有效；项目竣工验收是否存在超概算、超标准、超规模等三超现象以及项目竣工实施、运行效果是否达到预期等情况。
项目产生的效果：项目直接收益率、财政贡献率、项目预期投资回收期等等。
（三）国有控股公司的绩效审计评价指标
我国在 80 年代就开始探索国有企业的经济效益审计，并取得了一定成果，当前对国有控股公司的绩效审计仍可采用财政部印发的《国有资本金绩效评价指标体系》，如表 3 所示：
上述分析只是对政府绩效审计评价体系作一个粗浅的探讨。在实际的审计工作过程中，每类评价指标还需要更加具体细化的指标构成，而由于评价项目的多样性，具体的评价指标也可能会千差万别。这就要求审计人员必须针对每一个项目的审计目标、审计特点，与被审计单位进行充分地讨论与沟通，根据被审计单位衡量或评价自身工作成果的绩效指标和特点，有针对性地选择和制定适当的指标。
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